تمثلت النواة الأولى لجامعة أم درمان الإسلامية  في المعهد العلمي الذي أنشئ في عام 1321 هـ الموافق له  العام 1900 م ، ومرت بعدة أطوار إلى أن انتهت إلى ما هي عليه  الآن حيث توسعت وشملت تسع عشرة كلية وخمسة  معاهد وعدة مراكز  ووحدات داخل وخارج السودان وتبوأت موقعاً مرموقاً بين الجامعات السودانية ، ولعل أهم ما يميز الجامعة هو رسالتها الإسلامية .

     تعود نشأة الكلية الدعوة الإسلامية إلى عام 1965م عندما أنشئ قسم الدعوة بكلية أصول الدين وظل يؤدي عمله طوال تلك الفترة .

في عام 1990م تمّ دمج قسم الدعوة من كلية أصول الدين والتربية وقسم الصحافة والإعلام من كلية الآداب ليكونا كلية الدعوة والإعلام حيث أصبحت الدعوة تضم ستة أقسام هي :

1 – الدعوة الإسلامية

2 – مقارنة الأديان

3 - الاحتساب والرقابة الشرعية 

4 – المؤسسات الدعوية

5 – الدراسات الغربية

6–الدراسات الإفريقية والآسيوية

     وخلال هذه الفترة تخرج الطلاب في اختصاصي الدعوة والاحتساب ومقارنة الأديان والتيارات الفكرية المعاصرة في مستوى البكالوريوس والدبلوم العالي والماجستير والدكتوراه . وفي عام 1997م أعيدت الدعوة مرة أخرى إلى كلية أصول الدين تحت قسمي :

 1 – الدعوة الإسلامية.

2 – مقارنة الأديان.

     على أن يخرج القسمان مع الاقسام الأخرى في كلية أصول الدين طلاباً مختصين  في مجال الدراسات الإسلامية في مرحلة البكالوريوس وتكون  الدعوة مطلوباً من مطلوبات الجامعة في جميع الكليات.

     وفي عام 1999م تمّ دمج قسم الدعوة مع قسم الثقافة الإسلامية فصارا قسماً واحداً تحت اسم الدعوة والثقافة الإسلامية على أن يخرجا طلاباً في مرحلة الدراسات العليا  ( الدبلوم العالي والماجستير والدكتوراه )

     وفي ديسمبر 2000م قرر المجلس العلمي " مجلس الأساتذة " أن يمنح القسم درجة الاختصاص في البكالوريوس في المرحلة الجامعية باسم الدعوة والثقافة الإسلامية .

أما في عام 2002م قرر مجلس الأساتذة إنشاء كلية مستقلة تحت اسم ( كلية الدعوة الإسلامية ) لتخريج طلاباً في مرحلتي البكلاريوس والدراسات العليا.